对于大多数人来说，吃益生菌是对人体有益的，可以维持人体肠道的菌群平衡，从而促进消化。吃益生菌拉肚子可能原因如下：患者腹内有很多有害菌，有益菌进入人体后，会和有害菌进行竞争，从而造成腹泻的症状，这种情况一般过几天等菌群稳定后就会消失。
一种情况就是医学上常说的赫氏消亡反应，因为患者刚开始服用，体内菌群较少，突然增加的菌群会让机体，来不及反应，进而造成这一现象。
饮食方面要多加注意，多喝一些温开水，要避免辛辣，刺激性的食物。最好以清淡易消化为好，平时一日三餐要定时，定量，注意多休息，要保持心情愉快。
如果患者体内存在很多有害菌，有益菌进入人体后，两者互相竞争，会引起腹泻，一般过几天，待菌群稳定后腹泻症状会消失。还有一种情况，医学上称为赫氏消亡反应，刚开始服用益生菌，体内菌群较少，机体短期内无法适应大量的益生菌，产生腹泻，一般2周内会消失，不需额外治疗。
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